В поданной в ЕСПЧ жалобе Колунов заявил, что его заключение под стражу на время рассмотрения дела было незаконным и необоснованно длительным. Кроме того, он пожаловался на условия содержания в СИЗО, в частности, на переполненность камер. В связи с этим Колунов требовал взыскать с российских властей компенсацию в размере 1 миллиона евро за бесчеловечное и унижающее достоинство обращение, а также за нарушение его права на свободу.
ЕСПЧ согласился с доводами заявителя и признал Россию нарушившей статью 3 (запрещение пыток) и статью 5 (право на свободу и личную неприкосновенность) Европейской конвенции о защите прав человека и основных свобод. При этом суд счел затребованную заявителем сумму компенсации завышенной и взыскал в его пользу 6 тысяч евро.
В январе Европейский суд по правам человека принял к рассмотрению жалобу на приговор в отношении 39 лимоновцев, захвативших приемную президента, и направил правительству России вопросы, касающиеся подробностей судебного разбирательства. Решение по этому делу пока не вынесено.
В жалобе утверждается, что Россия нарушила право лимоновцев на справедливое судебное разбирательство, гарантированное статьей 6 Европейской конвенции по правам человека. По словам адвоката Дмитрия Аграновского, было нарушено, в частности, право обвиняемых на защиту. "Мы не могли допрашивать свидетелей обвинения так, как это делала сторона обвинения. Кроме того, мы не имели возможности встречаться ежедневно с нашими подзащитными в следственном изоляторе", — пояснил адвокат.
14 декабря 2004 года 40 активистов Национал-большевистской партии прорвались в здание приемной администрации президента на Ильинке и потребовали встречи с Владимиром Путиным, заявив, что уполномочены вести переговоры с главой государства от имени гражданского общества. Нацболы забаррикадировались в кабинете замглавы президентской администрации Владислава Суркова. Они вывесили в окно лозунг "Путин, уйди сам!" и распространили листовки с обвинениями в фальсификации выборов, политических репрессиях, убийстве заложников "Норд-Оста" и Беслана и других преступлениях. В тот же день все 40 человек были задержаны.
В 2005 году Тверской суд Москвы осудил восьмерых "декабристов" на сроки от 1,5 до 3,5 лет лишения свободы, 31 человек, в том числе Колунов, получил условный срок, один был освобожден по малолетству. Все сорок подсудимых были признаны виновными по статье 212 УК ("массовые беспорядки"), хотя первоначально им было предъявлено обвинение в попытке насильственного захвата власти.
В приговоре отмечалось, что те подсудимые, которым назначен реальный срок наказания, действовали умышленно. Суд объяснил, что проявил снисхождение к младшим фигурантам дела в силу их возраста. Он также счел, что подростки попали под влияние старших однопартийцев.